<aside> 💡

Dentro de la interfaz se puede mantener el mouse sobre los botones o los títulos para mostrar una explicación sobre el parámetro o la sección

</aside>

La interfaz se divide en 4 secciones principales:

Selector carpeta de salida

Muestra la carpeta de salida actual y permite cambiarla con el botón Cambiar , presionarlo abre un selector de carpetas en el catálogo donde se debe seleccionar la carpeta del paciente sobre el que se está haciendo la planeación.

Además tiene el botón Manual de usuario que dirije a este manual.

Selector de archivos

Contiene los botones para cargar los archivos de la resonancia de difusión

Al hacer clic en el botón Abrir desde DICOM se abrirá un selector para abrir desde una carpeta con archivos DICOM, cuando se seleccione se realizarán las conversiones necesarias y se exportarán en la carpeta de salida seleccionada o puesta de forma automática.

Usando los botones de Seleccionar para NIFTI, BVALS y BVECTS se mostrará una ventana para seleccionar un archivo .nii, .nii.gz o .txt, se debe seleccionar el respectivo archivo.

Botón para cargar el archivo NIFTI

si los tres archivos seleccionados son válidos el programa nos lo informará, en caso de que no, nos mostrará una ventana de error con la razón.

Por otro lado si tenemos los tres archivos de la resonancia procesados en la misma carpeta podemos hacer clic en el botón de Abrir desde carpeta y seleccionar la carpeta donde tengamos los tres archivos.

Ejemplo de carpeta con los tres archivos en ella

Esto es equivalente a seleccionarlos uno por uno.

Panel principal

Este panel es diferente en la interfaz simple y la avanzada, en la simple no se encuentran presentes algunas opciones y todas las que sí, están en la misma pestaña

Este panel se separa en 4 pestañas:

• Imagen: Tiene las opciones para editar la vista de la imagen

  • Color: Paleta para las vistas 2D

  • Threshold: Porcentaje de valores bajos que se ignorarán en el volumen 3D

  • Opacidad: La opacidad del volumen 3D

  • Cropping: Corte sobre el punto actual en el volumen

  • Mejora de imagen:

    • Corrección de movimiento: Corrige el movimiento de una serie fusionando cada imagen volumétrica entre sí, el tiempo del ejecución tardará dependiendo de la cantidad de imágenes en la serie
    • Eliminar ruido (ASCM): Quita el ruido de los resonadores con el algoritmo ASCM
    • Hacer isotrópica: Resamplea la imagen para que los voxeles tengan la misma distancia representatica, esta ayuda a las reconstrucciones si uno de los ejes tiene muy baja resolución en comparación con las otras. Es importante que si se va a usar esta opción se haga antes de realizar las reconstrucciones de tractos.

    

    

• Máscara:

  • 1: Selector de color para mostrar la máscara
  • 2: Slider para la transparencia
  • 3: Selector de máscara activa, esta se usa como base para generar modelos, picos y máscara threshold, también puede usarse como semilla para tractos
  • 4: Herramientas de edición para máscara
  • 5: Opciones para generar máscara otsu
  • 6: Opciones para generar máscara threshold

• Modelo:
  • Lista de modelos con sus opciones, botones para generar y para mostrar en 3D
  • Opciones para generar los picos, el selector de modelo que se usará para generarlos, el botón para generar picos y el selector de los picos generados activos
• Tractografia:
  • Selector de tractografia automática o manual
  • Opciones para tractografia manual
    • Selector de la máscara que se usará como semilla
  • Opciones para tractografia automática
    • Selector de dataset a usar
    • Selector de regiones de interés
    • Selector de tipo de transformación a realizar
  • Selector de densidad para la tractografia
  • Opciones de generación de tractos
  • Botón para generar la tractografia
  • Selector de tractos activos (Permite cambiar entre los generados en la sesión)
  • Selector de numero de clústeres objetivo y botón de agrupar
  • Botones para ver la tractografia en 3D y guardarla
  • Histograma de los tractos generados por distancia para filtrarlos

Panel vista

1. Temporizador de ultima tarea ejecutada
2. Selector de vista activa
3. Vistas 3D, axial, coronal y sagital
4. Slider para cambiar la serie actual
5. Slider para cambiar el corte actual
6. Tira de herramientas para modificar las vistas
   • Botones para cambiar el estado de la vista: La casa reinicia la vista activa y las flechas avanzan en los estados anteriores/siguientes
   • Botón para guardar la vista actual :guardar: : Abre un explorador para guardar como imagen la vista
   • Botón para activar herramienta para mover :mover: : Activa el estado de mover, clic izquierdo para mover y derecho para cambiar el zoom
   • Botón para activar herramienta para seleccionar :mouse_tool: : Al estar activa los clicks cambian el punto que se muestra en las vistas
   • Botón para activar herramienta de borrado de fibras :tract_borrar: : Al estar activa bloquea la cámara 3D y permite borrar fibras al darles click en las vistas 2D y 3D
   • Botones para alternar opciones de vista: :interpolacion: Activa y desactiva la interpolación, :cruz: muestra y oculta las cruces guía, :mascara: muestra y oculta máscara, :picos: muestra y oculta los picos
   • Botones para alternar vista de tractos 2D:
     • Ocultar tractos :ocultar-tractos:
     • Mostrar tractos en el corte actual :mostrar-tractos-corte:
     • Mostrar tractos completos proyectados en 2D :mostrar-tractos:
   • Botones para pantalla completa de la vista activa :fullscreen: y cambiar de corte ◀️ ▶️
7. Vista de información de la imagen actual